Minden elsődleges lipoproteinre jellemző, hogy egyedül, csak a benne lévő fehérje (apolipoprotein) összetételében van jelen. Az apolipoproteinek latin betűkkel vannak jelölve, amelyek közül néhány fehérjék családja, és számokkal is jelezhetők (például az apo-A1, apo-A2 stb.).