Az összes probiotikumot több csoportra osztják, attól függően, hogy mi az alapja a minősítésnek. A probiotikum-összetétel számos összetevőt tartalmazhat ebben a vonatkozásban olyan izolált monokomponens gyógyszerek, amelyek csak egy specifikus baktériumfajta. Ezek a mikroorganizmusok kétségtelenül hasznosak a bélben, különösen a mikroflóra esetében.