A pajzsmirigy mikrosomális frakciójához tartozó antitestek meghatározását az autoimmun pajzsmirigy-gyulladás és a hypothyreosis diagnosztizálására használják, amelyben az antitestek szintje a vérben emelkedik. Antitestek a pajzsmirigy mikroszómákat képeznek immunkomplexeket a sejt felszínén, aktiválják a komplement és citotoxikus limfociták, ami a sejtek pusztulását, és a kialakulását a gyulladásos folyamatot a pajzsmirigy.