Az MRI az agyi struktúrák állapotát azok körvonala, mérete és szövetsűrűsége alapján méri fel. Fontos megjegyezni, hogy az MRI a szövetek víztartalma alapján tükrözi a sűrűségét, ezért elsősorban olyan elváltozásokat azonosít, mint az agyödéma (CEE), a demielinizációs betegségek és a daganatok.