HCV-genom tartalmazza a pozitív töltésű egyszálú RNS, amely kódolja 3 strukturális (nukleokapszid mag fehérjéhez és nukleoproteineket E1-E2 borítékban) és 5 strukturális (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) fehérjék. Minden ilyen proteinek szintetizálódnak ellenanyagok találhatók a vérben a betegek hepatitis C