A protozoák kimutatása és differenciálása (a kórokozók és a nem kórokozó formák megkülönböztetése) meglehetősen összetett feladat. A székletben található egysejtű élőlények többsége két formában található meg: vegetatív (trofozoita stádium) - aktív, mozgékony, létfontosságú, könnyen érzékeny a káros hatásokra (különösen a lehűlésre), ezért a bélből való kiürülés után gyorsan elpusztul, valamint ciszták (oociszták) formájában, amelyek ellenállnak a külső hatásoknak.