A nyak medián cisztája az embrionális fejlődés korai szakaszában – a terhesség 3. és 5. hete között – kialakulhat, és klinikailag bármely életkorban megnyilvánul, de leggyakrabban az intenzív növekedés időszakaiban vagy a szervezet hormonális változásainak időszakaiban.