A szívizomgyulladás gyógyszeres kezelésének fő irányait a szívizomgyulladás patogenezisének főbb láncszemei határozzák meg: fertőzés okozta gyulladás, elégtelen immunválasz, a szívizomsejtek pusztulása (nekrózis és progresszív disztrófia, szívizom eredetű kardioszklerózis miatt), valamint a szívizomsejtek anyagcseréjének zavara. Figyelembe kell venni, hogy gyermekeknél a szívizomgyulladás gyakran krónikus gócos fertőzés hátterében jelentkezik, amely kedvezőtlen háttérré válik (a szervezet mérgezése és szenzibilizációja), hozzájárulva a szívizomgyulladás kialakulásához és progressziójához.